Бывалый блоггер и сеошник Сергей Кокшаров дает 10 признаков естественной ссылки. Очень понравилась его статья ссылка, поэтому привожу ее почти полностью:

Как выглядит естественная ссылка. 10 признаков

Итак, какие же основные признаки естественной ссылки?

1. Ссылка размещена на странице сразу при её индексации, то есть не была добавлена позже. Ситуации, когда после нескольких лет существования на страницах появляются ссылки, особенно ведущие на ресурсы, никак не связанные с текущим, выглядят подозрительно.

2. Видна для пользователя на странице. Если ссылка закрывается, значит она сделана не для пользователя. При обнаружении подобных исходящих ссылок, на сайт часто накладывают санкции. Это также вредит и тем ресурсам, кто размещается на этих площадках.

3. Расположена в контентной части (не в сквозных блоках). Ссылки для людей чаще размещают в контентной части сайта.

4. Часто содержит в тексте просто адрес страницы или повторяет title той страницы, на которую ссылается. Люди редко ссылаются на другие сайты, используя коммерческие анкоры. Чаще всего в естественном ссылочном профиле используется просто адрес страницы.

5. Иногда закрыта в nofollow. Nofollow говорит роботу, что это ссылка не для него, а значит для пользователя.

6. Иногда имеет вид картинки-баннера. Ссылки-изображения используются редко именно для SEO, поэтому, они ценны для поисковой системы и могут считаться более естественными (у Сергея был удачный эксперимент с ссылками-изображениями).

7. Используется не одна в контенте, а соседствует с другими тематическими ссылками. Если статья содержит лишь ссылки на один ресурс, чаще это заказная статья и выглядит в глазах поисковой системы искусственно. Как только в статье появляются ссылки на другие тематические ресурсы, каждая ссылка приобретает естественный вид.

8. Заголовок и текст страницы, на которой расположена ссылка, пересекаются с текстом на странице, куда ведет эта ссылка. Тематическая близость страниц донора и акцептора может давать хороший сигнал естественности связывающей их ссылки.

9. На страницу с расположенной ссылкой ссылаются другие ресурсы. Покупные статьи с ссылками часто никому не интересны и ценность подобных ссылок мала. Как только покупная (или естественным образом появившаяся) статья становится более-менее популярной, ссылки в ней приобретают ценность.

10. Ресурс, на котором проставлена ссылка, хорошо модерируется и ссылается лишь на тематические сайты. Даже очень хорошая по всем остальным признакам ссылка, идущая с заспамленного ресурса будет выглядеть неестественной.

Выше перечислены основные признаки. Если ссылки сайта не соответствуют многим из этих пунктов, то стоит пересмотреть его стратегию продвижения. 

Подписываюсь под статьей Сергея. А вы знаете еще какие-то дополнительные критерии естественной ссылки?

Как только покупная (или естественным образом появившаяся) статья становится более-менее популярной, ссылки в ней приобретают ценность.

откуда берется вот эта хрень

Это не хрень. Популярная статья обретает (может обрести) многие входящие ссылки, притом среди них могут быть весьма жирные, и потому вес исходящих с нее возрастает.

и да, еще говорят если сделать задание в юзераторе на заход и кликанье по ссылки то естественность ее увеличивается

Однозначно, вообще юзератор это двигатель интернета, даже сеосылку он может сделать естественной. Ну правда потом за накрутку ПФ будет "отпуск".

Считаете, что так просто? Думаете ТОРом можно обмануть? Тоже думал об этом

6. Иногда имеет вид картинки-баннера. Ссылки-изображения используются редко именно для SEO, поэтому, они ценны для поисковой системы и могут считаться более естественными (у Сергея был удачный эксперимент с ссылками-изображениями).

От себя замечу, что банеры отлично работают и во внутреннем ссылочном.

Это интересно и нестандартно 

Сам удивился, но банер с alt даёт больше веса чем простая ссылка из бокового блока или ещё откуда.

разница в размере занятого пространства...

Я и не предлагаю использовать их повсеместно вместо обычных ссылок, а вот комбинировать очень даже рекомендовал бы

А РЕАЛЬНЫЙ эффект от естественных ссылок кроме переходов по ним есть?

Если алгоритм Яндекса определил ссылку как естественную, после ссылочного апдейта ждите улучшения позиций